Η βούρτσα της ηλεκτρικής σκούπας, εκτός από σκόνη, μπορεί να συλλέξει από το πάτωμα ακόμα και βακτήρια (κάποια μάλιστα επικίνδυνα για την υγεία). Για να αποφύγεις την εκ νέου διασπορά τους στον χώρο, καλό είναι να την καθαρίζεις, μόλις τελειώνεις το σκούπισμα, και να την ψεκάζεις με ξίδι κάνοντας φυσική απολύμανση. Κατόπιν θα την αφήνεις να στεγνώνει σε εξωτερικό χώρο και μετά θα την αποθηκεύεις.
Οι παθογόνοι μικροοργανισμοί ζουν επίσης και μέσα στη σακούλα του κάδου, οπότε πρέπει να την αλλάζεις συχνά (πριν γεμίσει τελείως). Έτσι και η σκούπα θα λειτουργεί πιο αποτελεσματικά και ο κίνδυνος διασποράς μικροβίων θα είναι μειωμένος.
Επιπλέον, για να καλύπτεις τις μυρωδιές, μπορείς σε κάθε νέα σακούλα που αλλάζεις να ρίχνεις μια κουταλιά της σούπας μαγειρική σόδα (η οποία είναι επίσης απολυμαντική).
Πάντως, οι ειδικοί προτείνουν ως καλύτερη ηλεκτρική σκούπα αυτή που τραβά τη σκόνη μέσα σε κάδο με νερό, ο οποίος μετά από κάθε χρήση αδειάζεται και πλένεται.
